副教授
皇冠体育研究方向:生物化学,结构生物学电子邮件:r-rajan@ou.edu办公地址:SLSRC 2770
教育背景:学士(1998年),印度喀拉拉邦喀拉拉邦农业大学博士(2007年),俄亥俄州立大学博士后(2007-2013年),伊利诺斯州埃文斯顿西北大学皇冠体育研究助理(2013-2014年),伊利诺斯州埃文斯顿西北大学
皇冠体育研究关键词:蛋白-核酸相互作用,CRISPR- cas系统,结构生物学,基因编辑,CRISPR适应
CRISPR-Cas系统的机制
蛋白质与核酸的相互作用是许多基本生命过程的关键。我们实验室的主要重点是表征细菌和古细菌免疫系统CRISPR-Cas(聚集规则间隔短回文重复序列- crispr相关)的蛋白质- dna - rna相互作用。CRISPR- cas是一种基于RNA的适应性免疫系统,它根据小RNA(称为CRISPR RNA (crRNA))与入侵遗传元件的序列相似性,使进入细胞的外源DNA和/或RNA失活。这个过程需要几种叫做Cas蛋白的蛋白质。CRISPR-Cas9系统已经彻底改变了基因组编辑领域,因为使用向导rna和Cas9蛋白可以很容易地在细胞中实现靶向双链DNA断裂。
我们实验室的长期目标是破译Cas蛋白-核酸复合物的原子相互作用和构象变化,以开发用于基因组应用的高保真CRISPR-Cas系统。为此,我们专注于Cas9和Cas12a的结构和机制,这两种蛋白质广泛用于基因组应用和诊断目的。另一个重点领域是确定在CRISPR适应过程中对位点特异性至关重要的蛋白质- dna相互作用,细菌和古细菌将一段入侵者基因组插入CRISPR位点以提供未来针对特定入侵者的免疫保护的过程。我们也对了解CRISPR系统在细菌生理学中的替代功能感兴趣,例如,CRISPR- cas系统对增强细菌致病性和毒力的贡献。我们结合分子生物学,生物化学,x射线晶体学,生物信息学,以及其他生物物理和计算工具来皇冠体育研究CRISPR-Cas系统。