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苏珊·施罗德

苏珊·施罗德

苏珊·施罗德

副教授

皇冠体育研究方向:物理,结构生物学电子邮件:susan.schroeder@ou.edu办公:SLSRC 3590

教育背景:学士(1995年),纽约州罗切斯特大学(University of Rochester),博士(2002年),纽约州罗切斯特大学(University of Rochester),博士后(2002-2005年),耶鲁大学(New Haven, Connecticut)

皇冠体育研究关键词:生物物理化学,病毒RNA,病毒-宿主相互作用,纳米孔测序,结构生物学,RNA热力学,RNA结构预测


NMR Structure of pRNA E-loop hairpin

探索RNA的结构、功能和能量学

Schroeder实验室的长期科学目标是充分了解RNA的结构和功能,以预测其三维结构。病毒RNA的新功能和动态结构为更好地理解决定RNA结构、功能和能量学的基本物理相互作用打开了大门。

Experimental constraints define regions of RNA folding funnel

施罗德实验室的皇冠体育研究主要集中在三个方面:卫星烟草花叶病毒RNA (STMV);前体RNA (pRNA);和RNA热力学参数,以获得更好的RNA干扰(RNAi)治疗。我们正在开发更好的方法,利用晶体学数据、化学探测数据和计算预测来确定病毒颗粒内的STMV RNA结构。皇冠体育研究STMV RNA的实验和计算方法将应用于其他病毒RNA,如乙肝前基因组RNA和MS2噬菌体RNA,这些病毒RNA具有明确的体外组装条件,用于皇冠体育研究RNA折叠和病毒组装。pRNA是病毒包装马达的重要组成部分,并自组装成RNA纳米颗粒。施罗德实验室利用各种生物物理技术,包括核磁共振光谱、晶体学、凝胶位移测定和超快飞秒荧光光谱,探索pRNA的三级结构和动力学。


RNA helices inside satellite tobacco mosaic virus

利用紫外光谱测量末端错配的RNA热力学参数有助于建立数据库,形成大多数RNA预测程序的核心。末端错配的准确稳定性对于理解RNAi现象的特异性和减少RNA治疗的脱靶效应至关重要。