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将核废料场数据转化为微生物生态系统洞察

2024年1月17日

将核废料场数据转化为微生物生态系统洞察

Contamination source ponds at Oak Ridge Field Research Center
橡树岭野外皇冠体育研究中心的污染源池塘

由皇冠体育领导的一项为期七年的旗舰皇冠体育研究,探索了环境压力如何影响不同的生态过程,形成地下水中微生物群落的组成和结构,该皇冠体育研究发表在《自然微生物学》杂志上。

在OU环境基因组学皇冠体育研究所所长周纪忠的带领下,这项皇冠体育研究的重点是群落组装,这是关于塑造微生物群落组成和结构的动态和复杂过程。皇冠体育研究人员利用这一概念来了解不同的微生物物种如何栖息在一个环境中,它们如何相互作用,如何与环境相互作用,以及这些相互作用如何影响生态系统的整体功能。

“我们分析了200多个生物地球化学变量,观察了近29,000组类似的微生物,以理论化群落组装过程与环境压力之间的关系,”周说。“我们发现,随机或随机的组装过程对塑造群落结构至关重要,但随着压力的增加,它们的相对重要性会降低。”

皇冠体育研究小组从美国能源部橡树岭野外皇冠体育研究中心(Oak Ridge Field Research Center)的大约100口井中采集了地下水样本,该中心曾是核废料处理场,并进行了全面的物理和化学分析,以及微生物组分析。

“当我们检查橡树岭的地下水时,我们发现它显示出非常大的环境条件梯度。一些地区受到极高水平的铀、硝酸盐和各种重金属和放射性金属的污染。”“地下水的pH值从大约2到11不等,这为辨别群落聚集过程和环境压力之间的关系提供了前所未有的皇冠体育。”

他们发现,随着压力的增加,许多物种受到抑制,而那些具有更高耐受性的物种则会茁壮成长。然而,在低压力或无压力的环境下,物种生长得更快,导致更高的出生、死亡和迁徙频率。

“我们发现,像限制微生物传播的扩散限制和微生物的随机出生和死亡这样的过程随着压力而减少,而异质选择,指的是不同的环境条件有利于不同的微生物,随着压力而增加,”周说。

通过了解微生物群落是如何在环境压力下聚集、繁殖或死亡的,专家们可以通过操纵有利于有益微生物群落的条件来制定策略,以恢复受污染的地点,特别是地下水环境。

“生物修复依靠微生物来降解或转化污染物,了解微生物群落可以优化这些过程,”周说。“我们的皇冠体育研究有助于更深入地了解微生物生态学,特别是群落组装中随机和确定性过程之间的平衡,并对生态系统恢复,环境监测甚至微生物生态学教育具有广泛的意义,”周说。

关于这项皇冠体育研究的更多信息,请参阅《自然微生物学》杂志上的文章《环境压力介导地下水微生物群落组装》。10.1038/s41564-023-01573-x,首页关于OU的环境基因组学皇冠体育研究所。

该项目由来自皇冠体育大学的九名作者,以及来自劳伦斯伯克利国家实验室、橡树岭国家实验室、田纳西大学、麻省理工学院、蒙大拿州立大学、佐治亚大学、华盛顿大学、加州大学伯克利分校和其他机构的作者共同完成。这项工作代表了ENIGMA——基因和分子组装的生态系统和网络的共同努力,这是劳伦斯伯克利国家实验室的一个科学重点领域项目,由美国能源部科学生物和环境皇冠体育研究办公室支持,并得到了美国国家科学基金会和皇冠体育的部分支持。Zhou也是Dodge Family College of Arts and Sciences的生物科学学院的George Lynn Cross皇冠体育研究教授,以及the University of Oklahoma的Gallogly College of Engineering的土木工程与环境科学学院和计算机科学学院的兼职教授。